NVIDIA 推出 BioNeMo 開源框架，擴大全球生物制藥和科學行業(yè)的數(shù)字生物學研究規(guī)模

  ICC訊 NVIDIA 宣布，全球制藥和科技生物行業(yè)的領(lǐng)導者、學術(shù)先鋒和 AI 研究人員正在使用開源的 NVIDIA® BioNeMo? 框架，來推進藥物研發(fā)并加速分子設計。

  研究人員需要專門的生物分子模型和數(shù)據(jù)集來大規(guī)模地收集洞察，以便更快地設計治療方案。開源 BioNeMo 框架提供了一系列加速計算工具，旨在為生物分子研究提供指數(shù)級擴展的 AI 模型，為生物制藥領(lǐng)域帶來新的超級算力水平。

  NVIDIA 醫(yī)療健康與生命科學總經(jīng)理兼副總裁 Kimberly Powell 表示：“最近的諾貝爾化學獎證明了 AI、加速計算和日益擴大的數(shù)據(jù)集的融合為制藥行業(yè)創(chuàng)造了前所未有的機遇。為了幫助解開生物系統(tǒng)的復雜奧秘，我們推出了 BioNeMo 開源框架，它將使全球各地的研究人員能夠更快開發(fā)出挽救生命的治療方法。”

  領(lǐng)先的生物技術(shù)公司、科技生物研究人員以及 AI 平臺公司與組織已經(jīng)或即將為這一開源框架做出貢獻，包括 A Alpha Bio、美國阿貢國家實驗室、Dyno Therapeutics、羅氏集團的成員基因泰克、Ginkgo Bioworks、Relation、VantAI 和 Weights & Biases。另外，以推動計算科學發(fā)展著稱的領(lǐng)先重點科研機構(gòu)也使用 BioNeMo 框架推動創(chuàng)新。

  美國阿貢國家實驗室計算科學小組負責人 Arvind Ramanathan 表示：“美國阿貢國家實驗室貢獻了數(shù)十億參數(shù)的生物模型，這些模型需要使用專門的軟件在高性能計算環(huán)境中訓練而成。BioNeMo 為美國阿貢國家實驗室和更廣泛的生物技術(shù)社群提供了一個企業(yè)級開源解決方案，使研究人員能夠在本來不具備足夠的計算專業(yè)知識的實驗室中，輕松擴展大型生物基礎模型的訓練規(guī)模?！?

  推出下一代 BioNeMo 平臺

  這個端到端 NVIDIA BioNeMo 平臺專為加快 AI 藥物研發(fā)和分子設計模型的創(chuàng)建、定制與部署而設計。通過與加速計算基礎設施無縫集成，該平臺能夠降低成本、擴大規(guī)模，并加快藥物研發(fā)流程的速度，進而從生物分子數(shù)據(jù)中提煉出快速、可靠的洞察。

  除 BioNeMo 框架外，該平臺還支持 NVIDIA NIM?(經(jīng)過優(yōu)化的安全、可擴展 AI 推理微服務)和 NVIDIA BioNeMo Blueprints，后者是針對濕實驗室和計算工作流的優(yōu)化參考設計。

  NVIDIA 還發(fā)布了適用于 BioNeMo 的一系列經(jīng)過優(yōu)化且易于使用的全新 NIM 微服務。這些微服務可以快速、輕松地部署在本地或任何數(shù)據(jù)中心或云中，使開發(fā)人員能夠在各種不同的環(huán)境中靈活運行應用，并縮短了生物藥物研發(fā)研究中從推理到獲得洞察的時間。

  新推出的 NIM 微服務支持業(yè)界領(lǐng)先的模型，包括：

  AlphaFold2 是谷歌 DeepMind 開發(fā)的深度學習模型，該模型專為改變蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預測而設計。通過使用適用于 BioNeMo 的 AlphaFold2 NIM 微服務，研究人員近乎實時地預測蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的速度提高了 5 倍。

  DiffDock 2.0 基于麻省理工學院的研究成果，并在金標準 PLINDER 數(shù)據(jù)集上訓練而成。借助 DiffDock 2.0 NIM 微服務，研究人員預測分子取向的速度提高了 6.2 倍，準確率提高了 16%。

  RFdiffusion 和 ProteinMPNN NIM 微服務幫助研究人員更快設計出與目標分子結(jié)合的新型蛋白質(zhì)，并推動新的蛋白質(zhì)療法的創(chuàng)造。

  BioNeMo 現(xiàn)在加入了包括 cuEquivariance 在內(nèi)的全新加速庫，能夠加速 DiffDock 化學預測所必需的數(shù)學計算。

  企業(yè)可以使用 NVIDIA BioNeMo Blueprints(一個可定制的參考 AI 工作流目錄)來幫助開發(fā)人員將其 AI 部署擴展為企業(yè)級生產(chǎn)管線。

  用于虛擬篩選的 BioNeMo Blueprint 提供了一個可定制且易于遵循的工作流，不但能夠使用 NIM 微服務來更快設計出小分子，同時還能節(jié)省時間和成本。

  目前已有 200 多家科技生物公司、大型制藥公司和初創(chuàng)企業(yè)用戶將 BioNeMo 集成到其計算機輔助藥物研發(fā)平臺和工作流中。

  埃森哲、亞馬遜云科技(AWS)和德勤等全球系統(tǒng)集成商、軟件提供商和云服務提供商正在將 NVIDIA BioNeMo Blueprints 帶給全球各地的企業(yè)。

  關(guān)于NVIDIA

  NVIDIA(NASDAQ：NVDA)是加速計算領(lǐng)域的全球領(lǐng)導者。